Eijk is een conservatieve katholiek en is een voorstander van traditionele katholieke leerstellingen, zoals het celibaat voor priesters en de onfeilbaarheid van de paus. Hij is ook een voorstander van de dialoog tussen katholieken en andere religies.
Eijk is de leider van de katholieke kerk in Nederland, die ongeveer 4,5 miljoen gelovigen telt. Hij is ook de voorzitter van de Nederlandse bisschoppenconferentie.